Après avoir été conservateur des musées de Martigues, puis chargée de la décentralisation culturelle à la Délégation aux arts plastiques du ministère de la Culture, Joëlle Pijaudier-Cabot devient directrice du musée d’Art moderne de Villeneuve-d’Ascq puis prend la direction des musées de Strasbourg ou elle développe le service des publics.
Elle a fait partie des comités de réflexion pour la mission Musées du XXIeme siècle piloté par Jacqueline Eidelman.